Havalandırma havuzu, arıtma sürecinin en aktif bölgesidir. Burada oksijen transferi sağlanarak mikroorganizmaların organik maddeleri parçalaması desteklenir. Anoksik havuzu, oksijenin bulunmadığı ortamda azot bileşiklerinin giderildiği denitrifikasyon sürecinin gerçekleştiği bölümdür. Biyolojik çökeltme havuzu ise işlem sonunda aktif çamurun sudan ayrıldığı, duru suyun elde edildiği son aşamayı oluşturur. Bu üç birimin uyumlu çalışması, yüksek verimli bir arıtma performansı sağlar.