Biyolojik çökeltim havuzları, biyolojik arıtma sonrasında oluşan aktif çamurun sudan ayrıştırıldığı son çöktürme ünitesidir. Çöken çamurun bir kısmı prosese geri döndürülürken, arıtılmış su bir sonraki aşamaya veya deşarja yönlendirilir. Bu sistem, yüksek su kalitesi elde edilmesinde kritik bir görev üstlenir.